第二节 基本方法

许多数据库都提供方便的检索工具，即所谓的网上查询系统。下面介绍三个常见数据库的检索工具：Entrez检索工具。Entrez是美国NCBI提供的集成检索工具，利用Entrez系统，用户不仅可以方便地检索GenBank的核酸数据，还可以检索来自GenBank和其他数据库的蛋白质序列数据、基因组图谱数据，也可检索来自分子模型数据库（MMDB）的蛋白质三维结构数据、种群序列数据集等数据库（图21-3）。只进行相似性比对还不能对蛋白质的功能作出最终的判断，还需要根据蛋白质序列中的一些特殊结构如磷酸化位点、糖基化位点 ......