并非所有FD患者都需要药物治疗,药物治疗亦不能消除FD患者的各种症状。改变不良的饮食和生活习惯(如过度烟酒等),去除焦虑,建立信心,调整体质(如减肥等),避免可能的诱因如NSAID等药物,亦可使症状得到一定控制。部分患者尤其是症状顽固者,常有情绪不稳定、敏感、多疑,易受环境影响等性格缺陷,必要的心理治疗亦很重要。症状不典型或不固定,治疗以对症治疗为主。其中多伴有抑郁和焦虑状态,须同时抗抑郁、抗焦虑治疗,个别严重的患者须转精神科治疗。对合并有Hp感染的FD患者,在其他治疗无效时可考虑抗Hp治疗。抗Hp治疗可采用与治疗消化性溃疡相同的三联或四联治疗。症状复发时又重新给予相同药物或换用其他药物治疗。
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