这里分别描述了CYP2D6和NAT2的4个和7个多态性位点的多重基因型分析,通过在每一个反应中加入更多的引物,在增大工作量的同时,每一次多重微测序反应能确定的多态性位点明显增加。在上述应用中,采用了长度相差3个核苷酸的引物,它们能在15cm短胶上快速电泳分离。长度相差2个甚至1个核苷酸的引物能够很容易地用标准DNA测序胶分离,估计链霉亲和素包被的多面支持物或磁微粒可以捕获20~30种不同的PCR产物,这样每个反应中可被分析的PCR扩增模板的数目将有很大增加。