细菌灭活疫苗的主要优点可概括为:生产工艺简单,质量容易控制。不能在体内繁殖,比较安全,无毒力返祖现象。主要的缺点除副作用较大外,只能诱导机体产生体液免疫。细菌灭活疫苗在疫苗发展历史上起到非常重要的作用,但副作用问题一直困扰着人们。随着对各类病原细菌基础研究的深入,包括致病机制、免疫应答以及细菌基因组和蛋白质组等方面,同时各类生物技术的迅猛发展,新疫苗的研究取得了不同程度的进展。采用其他接种途径也是细菌灭活疫苗研究的一个方面,如口服霍乱全菌体疫苗,已证明其安全性和有效性。