较普遍的观点认为:只有在含水的环境中微生物才能存活。但也有人发现在无水碳氢化合物中微生物可长期存活。有些微生物的碳源必须来自有机碳化合物如糖、蛋白质、脂肪、有机酸等(同时利用其化学能),属异养型。有些微生物不需有机碳化合物,以CO 2为碳源,属自养型(分为光能自养型和化学能自养型)。包括维生素、嘌呤和嘧啶等。