[速览]四、蛋白质序列数据库

肽指纹图谱（PMF）鉴定蛋白质是依赖于蛋白质序列数据库的，完整的数据库和清晰明了的PMF，以及快捷的计算机分析系统结合，才能正确地鉴定蛋白质。目前蛋白质数据库主要来源于Swiss‐Port，TrEMBL，和TrEMBL‐new三个由权威专家所认可的蛋白质信息库。在美国国家生物信息中心的网站http：／／ncbi ﹒ nlm ﹒ nih ﹒ gov上可以查询到最新的蛋白序列数据库。每个蛋白酶都有特异性识别位点，利用数据库信息，我们可以将蛋白质样品进行虚拟的酶解，产生了一系列的多肽，我们可以计算每个多肽的质量。这使得质量纹算法不是理想的分析复杂混合物中蛋白成分的方法。