中药指纹图谱可用于中药制剂研究、生产过程的各个阶段。狭义的中药指纹图谱是指中药化学(成分)指纹图谱。广义的中药指纹图谱则可按以下应用对象、测定手段等进行不同的分类。在得到相对完备的中药指纹图谱后,应进入研究的高级阶段,即指纹图谱特征和药效相关性研究,指纹图谱的生物等效性研究。初级阶段积累的数据可为高级阶段提供基础,能体现化学和药效相关综合信息的指纹图谱,必定能为中药走向世界主流医药市场提供可靠的质量保证。