冠醚属大环聚醚类物质,分子结构为中间是空穴的平面结构,分离对映体的机制与环糊精相似,能与大小相当的客体分子形成包合物。这类化合物中18‐冠‐6‐四羧酸(18C6H4)可分离氨基酸、多巴胺、二肽和三肽等多种含氨基的对映体。由于水的存在会减弱冠醚与铵离子的相互作用,且冠醚较昂贵,其应用受到一定限制。