（一）PDB

从1998年开始，由结构生物信息学合作研究协会（RCSB）管理。PDB收集X射线衍射和核磁共振获得的蛋白质结构数据，经过整理和确认后存档。PDB数据库包括蛋白质、多肽、病毒、核酸、蛋白‐核酸复合物及少量多糖分子的原子坐标，以文本文件的方式存放数据。