自身免疫病的组织损伤主要由Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ型超敏反应引起,参与损伤过程的因素有抗体、补体、抗原抗体复合物、T细胞、巨噬细胞、NK细胞和K细胞。可溶性抗原与自身抗体结合,形成免疫复合物,随血液循环沉积于某些部位,不仅干扰组织器官的正常生理功能,而且可通过补体,引起炎细胞浸润,导致组织损伤。巨噬细胞被淋巴因子激活后可释放溶酶体酶及细胞毒性细胞因子造成组织损伤。