理论化学计算方法在药物研究中得到了广泛的应用,从非经验的量子化学从头计算和密度泛函理论到经验计算方法,如分子力学和分子动力学,均在药物研究的不同层次得到了应用。然而现在用于药物受体相互作用的理论计算方法和计算机辅助药物设计方法,一般仅考虑药物与受体活性部分的作用情况,即药物与受体结合(binding)过程,至于药物是怎样到达活性部位的动态过程不予考虑。因此应在现有研究的基础上,发展适合于模拟药物在体内传输、与受体动态结合和药物代谢途径的理论方法,并在此基础上进行若干药理体系的药物作用机制和药物设计研究,逐步发展由SBDD向基于药物作用机制的计算机辅助药物设计(MBDD)方法。
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