生物活性物质的存在方式与其生物工程关系十分密切。生物活性物质分为“胞内”与“胞外”两种存在部位。而合成酶类、代谢酶类、遗传物质和代谢中间产物则存在于细胞内,如DNA聚合酶、细胞色素C等。真核细胞的DNA大部分存在于细胞核内,只有少量存在于线粒体和微粒体中,而RNA则主要存在于胞浆中,电子传递系统物质包括黄素蛋白、细胞色素类以及糖类、脂肪酸合成、氧化和氧化磷酸化有关的酶系大部分存在于线粒体中。细胞内的生物活性物质有些游离在胞浆中,有些结合于质膜或器膜上,或存在于细胞器内。针对产物的不同状态需选择不同的预处理方式,以减少各种杂质对后续分离纯化工艺的干扰,同时还要注意防止细胞内各种酶对产物的水解破坏作用。
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