多数患儿有体温不升或发热、反应低下、拒奶等全身症状。患儿气急、口吐泡沫、鼻翼扇动、吸气性凹陷、呼气性呻吟、发绀、呼吸暂停。少数表现为反应低下、口唇周围青灰、呼吸不规则、呼吸暂停、腹胀等。重症较易发生呼吸衰竭、心力衰竭、DIC、休克或持续肺动脉高压。衣原体肺炎呈明显肺气肿,两侧肺野弥散性间质浸润和斑片状肺泡浸润影。