三个数据库均为Gen Bank的重要组成部分。单核苷酸多态性数据库(db SNP)建立于1999年,是核苷酸变异、短片段缺失及插入导致的多态性的中心数据库。数据库可以通过不同的方式进行搜索,也可用于BLAST搜索。序列标记位点数据库(db STS)及表达序列标签数据库(db EST)是在寻找新基因及测序中常用到的数据库。