在一次过程中可同时进行若干个实验。若要分析大肠杆菌和(或)胎牛肝蛋白的提取物时,完全可以同时进行3个IEF实验。每一步骤必须戴一次性手套以避免污染。当分子标记和1D样品被用于SDS凝胶时选择18cm长的条带。高分子量的标记蛋白在2D凝胶中不甚理想,但它们在SDS凝胶上可作为1D样品。