在药动学中药物分子的立体化学结构和手性结构逐渐受到重视。一些精神药物存在具有不同生物特性的2种或2种以上的异构体(分子式相同但结构和性质不同的化合物)或对映体,一些上市的药物为不同异构体(如50 ∶。尽管对映体具有相同的物理化学特点,但在结合转运蛋白、药物代谢酶以及受体亲和力等生物系统的层面具有明显差异,所以认为它们是不同的药物分子实体。对映体在吸收、代谢、蛋白结合、排泄等药动学方面也有着根本的不同。近期成功开发单异构体的药物是艾司西酞普兰、右佐匹克隆和甲磺酸‐α‐二氢麦角隐亭(dihydro‐α‐ergocryptine mesilate)等。
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