药物分子可认为是由结构骨架与药效团构成,在一定意义上,模拟创新是在保持药效团的前提下变换或修饰骨架,通过电子等排置换、优势结构的替换或骨架迁越等分子操作,优化药效、药代、物化性质或安全性,并赋予结构以新颖性。