蛋白样品来自器官、组织、体液、离体细胞或亚细胞组分,根据不同的样品类型产生了不同的样品制备方法和分离手段,同时有多种检测仪器和软件程序可用来对双向电泳分离后的蛋白质的性质、数量进行分析,并对转录后修饰进行研究。