阵发性房颤的血栓栓塞发生率明显低于其他类型的慢性房颤,是否给予抗凝治疗应视每个患者的情况而定,如:是否存在瓣膜病,是否存在血栓栓塞的危险因素等。故有作者认为,无论是持续性还是阵发性心房纤颤,均应行抗凝治疗。但临床观察发现,抗凝治疗组栓塞性事件发生率低于未行抗凝治疗组,推测可能与心房纤颤发作间隔期发生过未被发现的心房纤颤有关。