生物信息学同样是蛋白质组学研究所必不可少的研究手段。生物信息学在基因组研究中已经显示巨大的作用,而生物信息学本身在这一研究中也获得了极大的发展。生物信息学与蛋白质组学研究的相互结合,必将对生命科学带来革命性的变化,对医药、卫生、食品、农业等产业产生巨大的影响。