由苗头化合物到先导物的演化过程,大都涉及骨架的变换,改变已有活性分子的母体结构。先导物的优化优势也涉及骨架迁越。骨架迁越目的有多方面考虑:1 .增加药物的溶解度,将亲脂性的骨架用极性骨架替换。经验告诉我们,药物的毒性或不良反应主要是由于骨架结构所致,例如吡啶和咪唑为骨架的药物常与细胞色素P450结合,呈现不良反应。一些活性分子的柔性键过多,如肽类药物,构象的多样性导致与受体的亲和力降低。中心骨架的改变形成了新的结构,能够获得专利保护。