恶性疟疾可选用的药物较多,例如蒿甲醚(别名青蒿素甲醚),本品对恶性疟近期疗效可达100%。适于抗氯喹的疟疾发病区的预防与恶性疟等的治疗。哌喹,本品抗疟作用与氯喹相似,本药对于抗氯喹性恶性疟有根治作用,但作用缓慢,宜在喹宁、青蒿素类或咯萘啶控制症状后续用本品。奎宁,该药可用抑制或杀灭良性疟(间日疟、三日疟)及恶性疟的红细胞内期疟原虫,能控制疟疾症状,有解热、子宫收缩作用。