4﹒2﹒1﹒2 三维数据库搜寻

三维数据库搜寻是利用计算机人工智能的模式识别技术，采用合理的搜寻标准（询问条件或提问条件），把三维结构数据库中的小分子数据逐一地与搜寻标准（即提问结构）进行匹配，通过计算小分子与靶标结合的静电力、氢键及范德华力等。寻找复合特定性质和三维结构形状的命中结构，从而发现合适的药物分子。尽管目前开发的分子对接程序仍存在许多大的挑战，如多柔性配体分子的构象搜索、生物大分子的柔性对接等，人们有理由相信，随着计算机技术日新月异的发展，基于分子对接模拟计算的辅助药物研究不断趋于完善，将成为现代药物发现必不可少的重要手段。