在二向分离前,必须要平衡IEF胶。平衡过程需要两个步骤,第一步的平衡液成分为50mmol/L Tris缓冲液(pH 8 ﹒。8),含有2%W/V SDS、20mmol/L DTT 6mol/L尿素和30%甘油。在电场作用下,各蛋白质依所带负电荷数目迁移,迁移速率与电荷数成正比关系,亦即实现了蛋白质相对分子质量方向上的分离。为了让SDS与蛋白质充分结合,必须加入尿素和还原剂等,以去除蛋白的高级结构以及亚基之间相互作用,尿素和甘油同时也用于减缓电渗效应,否则会使一向到二向的蛋白质转移率降低。平衡后上二向凝胶之前,IPG胶应沿边缘用滤纸吸1min以去除多余平衡液。
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