（三）连锁不平衡

在谈论连锁和连锁图谱之前，区分两个概念是很重要的，即物理的连锁和连锁的不平衡性。在人群标准中对基因突变的描述开始于对单个基因位点上等位基因的突变的考虑。第二步是同时考虑在两个或多个位点上的基因变异，包括非随机的连锁。非随机交配——植物间高水平的同系交配和自体繁殖可以减小达到连锁平衡的比率.这些关乎我们定位和鉴别疾病变种的能力，还关乎我们理解一些致病基因在一个种群中变得相对普遍的机制。