药学物质体系的辨识,其最基本的问题是辨识构成该物质体系的各化学组成及化学结构,即分析体系的定性定量。几乎所有药学物质体系的辨识问题可归结为:药学物质的定性定量分析问题和药学模式识别问题。药学信息学的主要研究任务是综合运用工程数学、非线性科学、多元统计分析技术、计算技术、信号处理技术和人工智能技术等学科的基本理论与方法,发展形成用于复杂体系的分析信号处理最优算法和获取分析信息的最佳策略。在药学信息工程方法学中,算法研究占有极为重要的位置,因而也是最富有活力和创造性的研究领域。