蛋白质分子的构象是以一级结构为基础,是表现蛋白质生物学功能或活性所必需。随着蛋白质分子结构研究的深入,又发现超二级结构(super secondary structure)或模块(motif)、结构域(domain)、亚结构域(subdomain)等一些表现有一定生物功能等空间构象。蛋白质的空间结构是蛋白质特有性质和功能的结构基础。由此也产生了相关蛋白质空间结构预测的方法,在预测一种新的蛋白质空间结构时,首先在已知的蛋白质空间结构数据库中查找是否有和此种蛋白质同源的蛋白质,当找到与此同源的蛋白质时,新的蛋白质空间结构就有可能和找到的同源蛋白质空间结构相似,预测可避免较多的盲目性。
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