生物化学蛋白质芯片上有一层活性的表面如环氧树脂等,能够通过亲核作用与蛋白质、DNA或化合物中的胺形成牢固的共价结合,与之共价结合的蛋白质或化合物称为诱饵蛋白质或物质,它们可以是抗体、受体、配体、酶、DNA或药物等。以抗原抗体反应为例,用于蛋白质芯片实验的抗体可以是单克隆或多克隆,最好的抗体是用抗原亲和纯化的单克隆抗体,用于免疫沉淀和ELISA的抗体也可以使用,单独用于WesternBlot的抗体纯度不够。图16在生物化学表面芯片用6E10抗体测定贝塔淀粉样肽的多种片段。