肠球菌属可分成5群,1群包括鸟肠球菌(E ﹒ avium)、类鸟肠球菌(E ﹒ pseudoacium)、棉子糖肠球菌(E ﹒ rafinosus)、解糖肠球菌(E ﹒ saccharolyticus)、灰黄色肠球菌(E ﹒ gilvus)、病臭肠球菌(E ﹒ malodoratus)、。淡黄色肠球菌(E ﹒ palens)。5群包括哥伦比亚肠球菌(E ﹒ columbae)。