三、表面积

在立体参数中，有大量的参数是与分子构象或分子的立体形状密切相关，这类参数被称为几何参数，如表面积SM、溶剂可及化表面积SSA、体积VM以及排除溶剂体积VSA。表面积可能是最重要的几何参数之一，因为分子表面与分子间色散能力以及在凝聚介质空腔中形成的自由能变化密切相关，另外配体分子和受体分子之间的几何匹配与分子的表面也是密切相关的。Connolly提出了溶剂探针分子滚过分子表面所形成溶剂可及化表面的求算方法（Connolly，1983）。PSA定义为分子中作为氢键受体的氮原子和氧原子及作为氢键给体的连接在氮原子和氧原子上的氢原子的表面积之和。