大量的观察者推出了修改的试剂或试验方案,以改进“基本”双杂交系统的功效。AD和DBD现在都能与专用装置在氨基端或羧基端融合,以减小在空间上阻碍参与蛋白质相互作用结构域构成的风险。可能更敏感或更方便可靠的新报告基因正在应用中,如:酵母α‐半乳糖苷酶(yeast α‐galactosidase,MEL1)、大肠杆菌β‐葡糖醛酸酶(Escherichia coli β‐glucuronidase)以及GFP。含有三种在不同GAL4诱导的启动子控制下的报告基因的宿主菌,能够消除GAL4系统中所有对启动子成分特异性的假阳性。甚至包括即将开始的双杂交教程(如果研究人员对各种选择和可用的试剂不知所措的话)。
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