存在于消化道中的水通道有AQP3、AQP4、AQP8和AQP10。由此推断,AQP3可能参与了这些上皮细胞的渗透压的维持。但是采用AQP4基因敲除小鼠研究表明,AQP4对胃酸的分泌没有作用。在小肠中还存在AQP10。