用于防治血栓形成或栓塞性疾病(如心肌梗死、血栓性静脉炎、肺栓塞等)。也用于血液透析、体外循环、导管术、微血管手术等操作中及某些血液标本或器械的抗凝处理。滴注前可先静脉注射5000U作为初始剂量。高危血栓形成患者,大多是用于腹部手术之后,以防止深部静脉血栓。在外科手术前2小时先给5000U肝素皮下注射,但麻醉方式应避免使用硬膜外麻醉,然后每隔8~12小时给5000U,共约7日。不可肌内注射给药。用药期间定期检查凝血时间,避免肌内注射其他药物。