Hofstadler等证明用毛细管电泳/电喷雾离子化傅立叶变换离子回旋共振质谱法(CE/ESI‐FTICR)分析直接从一个小的完整活细胞群(5~10个)中得到的蛋白是可行的。Berkemnkamp等用IR/MALDI‐TOF‐MS分析冻干蛋白、风干的蛋白溶液或分子量小于30ku的蛋白晶体时,没有添加其他基体而获得成功。