由于不同肽段离子化效率的差异,单独一个肽段的质谱信号很难直接反映该肽段所对应的蛋白的信息,但当一个蛋白质所有在一级质谱中被鉴定到的肽段质谱峰强度的平均值与该蛋白质在混合物中的量存在一定的对应关系,将所有的肽段的峰强度进行标准化。肽段的离子化能力也相当于被均一化了,平均的质谱峰强度将可能与蛋白的量具有一定的相关性。实验的基本策略是选取16~98kDa的6种标准蛋白酶切后,取100~15 000fmol的蛋白上样,利用Protein Lynx Global Server(PLGC)进行Q-TOF质谱离子强度信 ......