多肽类抗生素主要包括万古霉素、去甲万古霉素、替考拉宁、多粘菌素类、杆菌肽等。但万古霉素、去甲万古霉素、替考拉宁在化学结构式上含有可溶性糖肽,而且,在临床上对抗革兰阳性球菌,尤其是耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)是目前最有效的抗菌药物。因此,另列“万古霉素与其他糖肽类抗生素”一节中叙述。杆菌肽目前仅限于外用,各种软膏或霜剂每克含杆菌肽500~1000U,供敏感菌所致的皮肤伤口、软组织、眼、耳、鼻、喉和口腔感染用。杆菌肽全身用药有严重肾毒性,现仅供局部应用。