一、实验方法及操作步骤

用DS MODELER程序进行同源建模，操作简单，计算速度也比较快。MODELER程序自身带有序列和结构比对方法，如Align2D、Align3D和SALIGN。本实验中，我们采用MODELER程序，产生猪胰腺组织激肽释放酶（porcine pancreatic kallikrein A，PKA）的三维结构模型，我们选择了三个同源蛋白质作为模板。该实验包括以下操作步骤：1 ﹒用Align3D方法将三个模板蛋白进行结构比对。4.output文件夹中，查看计算结果，点击＊ ﹒ bsml文件，会出现结构比对结果，颜色代表同源性的高低，背景颜色越深，代表氨基酸的同源性越高（图1‐.图1‐19新建的蛋白质模型。