经氯喹作用,疟原虫的核碎裂,细胞浆出现空泡,疟色素聚成团块。已知氯喹并不能直接杀死疟原虫,但能干扰其繁殖。氯喹主要作用于红内期裂殖体,经48~72小时,血中裂殖体被杀灭。本品对间日疟的红外期无效,故不能根治间日疟。氯喹对红前期无效,对配子体也无直接作用,故不能作病因预防及中断传播之用。2)为2.5~10日,氯喹在红细胞中的浓度为血浆的10~20倍,而被疟原虫侵入红细胞内的氯喹浓度又比正常者高约25倍。约8%随粪便排泄,氯喹也可从乳汁中排出。