关于反相色谱的作用机制早期有多种理论模型,如分配色谱模型、吸附色谱模型等。从物理角度看,溶液中溶质的吸附现象发生在液固交接面,而分配现象是溶质从一种溶剂转移到另一种不混溶的溶剂中。由于非极性色谱法的固定相表面可以被流动相中的成分高度溶剂化,因而保留机制若是单独用以上两种机制的理想模型解释似乎都不恰当。正是由于分配色谱和吸附色谱在解释非极性键合相色谱保留机制时有本质区别,从而引导人们进一步探索非极性键合相色谱的保留机制。目前能比较合理地解释非极性键合相色谱保留特征的理论是疏溶剂作用理论和双保留机制。
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