通过产生灭活酶将药物灭活是微生物产生耐药的最重要机制之一。这些灭活酶可由质粒和染色体基因表达,如:内酰胺酶:β-内酰胺酶由染色体或质粒介导。正常情况下细菌外膜的通道蛋白由OmpF和OmpC组成非特异性跨膜通道,允许抗生素等药物分子进入菌体,当细菌多次接触抗生素后,菌株发生突变,使OmpF蛋白的结构基因失活而发生障碍,引起OmpF通道蛋白丢失,导致β-内酰胺类、喹诺酮类等药物进入菌体的量减少。由于这种主动外排系统的存在及它对抗菌药物具有选择性的特点,使大肠杆菌、金黄色葡萄球菌、表皮葡萄球菌、铜绿假单胞菌、空肠弯曲杆菌对四环素、氟喹诺酮类、大环内酯类、氯霉素、β-内酰胺类产生多重耐药性。
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