系巯嘌呤(6‐MP)的咪唑衍生物,在体内分解为巯嘌呤而起作用。别嘌醇可抑制巯基嘌呤(后者是硫唑嘌呤的活性代谢物)代谢成无活性产物,结果使巯基嘌呤的毒性增加,当二者必须同时服用时,硫唑嘌呤的剂量应该大大减低,硫唑嘌呤可降低6‐巯嘌呤的灭活率,6‐巯嘌呤的灭活通过下列方式:酶的S‐甲基化,与酶无关的氧化。硫唑嘌呤能与巯基化合物如谷胱甘肽起反应,在组织中缓慢释出6‐巯嘌呤而起到前体药物的作用。