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  5. 细菌分类与命名
共41

细菌分类与命名

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答:原核生物是指一类无真正细胞核的结构简单的单细胞生物。长期以来,人们一直认为原核生物只包括细菌一种类型,但在1977年,Woese发现了一群序列特异的细菌——古菌。......

原核生物即细菌吗?它们的区别是什么?
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答:细菌分类学(taxonomy)是对细菌进行分类、命名和鉴定的一门学科,它包括分类(classification)、命名(nomenclature)和鉴定(identification)三个方面的内容。......

什么是细菌分类学?
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答:细菌是一类肉眼无法观察到的单细胞微生物,经历了漫长的研究才形成了系统的分类学。1683年,荷兰科学家虎克发明了显微镜,并最先观察到细菌。根据显微镜观察的细菌形态,人们最初......

细菌是如何分类的?
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答:原核生物系统学是通过对原核生物系统发育的构建,根据原核生物之间的差异和相似性,推测不同原核生物从何种生物进化而来,以及进化的时间和顺序等的一门学科。原核生物系统学,在......

什么是原核生物系统学?其对于细菌的分类有何影响?
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答:原核生物系统学参照动植物的分类方法,以域、门、纲、目、科、属、种的分类阶元进行分类,此外,还有一些次要的等级分类单元,如亚门、亚纲、亚属、亚种等。分类等级的拉丁字母尾......

细菌的等级分类单元是什么?
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答:传统的细菌“种”的定义如下:种是细菌分类的基本单元,生物学性状基本相同的细菌群体构成一个菌种。然而,由于细菌的生物多样性非常丰富,对一个菌种的所有可能的生物......

细菌“种”的定义是什么?细菌“种”的定义主要有哪些变化?
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答:模式菌株(type strain)是被指定的细菌“种”的代表,是用于分类研究的“种”的参考模型。模式菌株可能不是一个种中最具有代表意义的成员,但通常是该种中......

什么是模式菌株?模式菌株和标准菌株有什么区别?
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答:目前,《临床微生物学手册》和《伯杰系统细菌学手册》均采用了原核生物系统学的分类方法,以体现细菌的进化和种群之间的亲缘关系,即,医学上细菌“种”的概念与原核生......

医学上的细菌“种”跟原核生物系统分类的“种”有何异同?
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答:模式菌种是指定的细菌“属”的代表,模式菌属则是指定的细菌“科”、“目”、“纲”等高阶分类的代表。作为分类研究中的参考模型......

什么是模式菌种?模式菌属?
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答:目前,与细菌分类关系最密切的国际学术组织是国际原核生物系统学委员会(International Committee on Systematic Prokaryotes,ICSP),其隶属于国际微生物学联合会(International U......

与细菌分类和命名有关的国际学术机构和组织有哪些?
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答:在发表一个新分类单元前,模式菌株都必须提前保存到2个不同国家和地区的国际性菌种保藏中心,并获得由菌种保藏中心提供的英文的馆藏证明。一些国际公认的菌种保藏中心见表3-1......

国际性的菌种保藏中心主要有哪些?
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答:目前,国际上相对权威的微生物分类网络资源主要有法国的LPSN与美国的NCBI。LPSN是法国学者Euzeacute;by经国际系统原核生物学委员会授权,于1997年3月建立的网站,网址为:http:/......

国际上常用的与微生物分类相关的公共网络资源主要有哪些?
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国际著名的菌种保藏机构答:登录LPSN网站的主页(http://www.bacterio. cict.fr/),原核生物属及属以上的分类单元按学名的拉丁文字顺排列为A~C、D~L、M~R和S~Z四段,继续点击进入属所示......

如何利用LPSN网络资源快速获取最新的有效命名的细菌分类信息?
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答:细菌分类(classification)是在全面了解细菌种类的起源、演化和相互关系的基础上,按照菌种之间的相似性或关联性,归类为属、科、目、纲、门的等级分类阶元。细菌鉴定是指按细菌......

什么是细菌分类?什么是细菌鉴定?
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答:细菌的鉴定和分类均需要采用类似的研究方法。不同的是,分类工作的研究对象是已知菌种,而鉴定工作的研究对象是未知的菌株。分类工作需要对已知菌种进行全面分析以掌握不同菌......

细菌鉴定和分类的主要区别是什么?
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答:细菌鉴定和分类的方法主要包括传统分类法、数值分类法、化学分类法、遗传学分类法等几大类。传统分类法和数值分类法都是以细菌的表型特征为基础,细菌的形态学检查、染色、......

细菌分类的方法主要有哪些?
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答:传统分类法以细菌的形态学和生物学性状为基础,选择一些较为稳定的生物学性状作为分类依据,然后按主次顺序逐级区分。传统分类法使用方便,操作步骤明确,但细菌形态学与生理特征......

什么是传统细菌分类法?传统分类法有什么特点?
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答:数值分类法是与计算机技术相结合而发展起来的细菌分类方法。它对细菌的各种生物学性状按“等重要原则”,选用50项以上的生理、生化指标逐一进行比较,通过计算机分......

什么是数值分类法?数值分类法的特点和成就是什么?
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答:遗传学分类法是以细菌的核酸、蛋白质等大分子物质的同源程度进行分类的方法。遗传学分类法的优点主要有:①有利于了解细菌的进化和原始亲缘关系,加深人们对于细菌的整体认识......

细菌遗传学分类法的主要优点有哪些?
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答:核糖体RNA基因编目法,通过分析比较不同物种的核糖体RNA基因序列四种不同碱基的组成和顺序,确定其在自然演化过程中的地位并进行分类。该方法先假设所有菌种均来源于一共同的......

核糖体RNA基因编目法的主要原理是什么?
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答:生物体内的RNA分子包括三类,分别为tRNA、mRNA和rRNA。rRNA即核糖体RNA,是RNA分子中含量最多、分子量最大的一种。rRNA单独存在时不执行其功能,但与多种蛋白质结合成核糖体后,......

什么是rRNA?16S rRNA与16S rDNA有什么区别?
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答:细菌的rRNA有5S、16S及23S三种,其中16S rRNA基因的编码序列常用于细菌的分类学研究。16S rRNA基因用于细菌的分类研究的优势有:①存在于所有的原核生物中,功能同源且最为古老......

为什么通常选用16S rRNA基因作为细菌分类的基因标志物?
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答:16S rRNA靶基因的DNA测序应用于菌种鉴定,依赖于迅速发展的互联网技术、计算机技术与分子生物学相结合而诞生的生物信息技术。世界范围内生物信息资源的交流、共享及在线核......

16S rRNA测序分析进行细菌鉴定的基本原理是什么?
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答:生物体DNA中的碱基的比例和排列顺序是决定DNA特性的关键因素,它代表了生物的遗传信息,决定了生物的种类。细菌的总的DNA(G + C)mol%含量变化范围大(为24%~76%),是细菌分类学研究的......

基因组DNA(G + C)mol%含量在细菌分类学中的意义是什么?
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答:基因组DNA杂交的原理是基于核酸变性和复性理论,将待检菌的DNA变性、解链为DNA,后与标记的参考菌株的单链DNA进行杂交,形成杂交的DNA-DNA杂交体。两种细菌DNA中共同的核苷酸序......

基因组DNA杂交的原理和意义是什么?
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答:①从细菌分类的角度上看,尽管遗传学分类法是细菌分类的重要依据,但由于细菌在自然演化过程中,不同的菌门、菌纲、菌目、菌科、菌属,甚至菌种之间,均不存在一个明显的基因分类的......

为什么说细菌的细胞化学组分分析在分类和鉴定中具有广泛的应用前景?
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答:细菌细胞膜的脂质双层中存在大量的脂肪酸,磷脂脂肪酸组成和含量水平,能够标志某一类或某种特定微生物的存在。细菌的细胞脂肪酸成分通常采用气相色谱法进行分析,但值得注意的......

细胞脂肪酸成分分析进行细菌鉴定的原理基本是什么?
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答:质谱(mass spectrometry,MS)是一种通过测定带电离子质量/电荷比(m/z,简称质荷比)而进行定性、定量检测的一种现代分析技术。质谱技术最初用于放射性核素、无机元素,以及小分子有......

质谱技术进行细菌菌种鉴定的基本原理和意义是什么?
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答:《细菌命名法》即《国际细菌命名法》,是1990年出版的一部管理细菌科学名称的法规,该法规由原则(principles)、规则(rules)和建议(recommendations)三个部分组成,英文全称为“I......

何谓《细菌命名法》?如何通过网络查找细菌命名更新信息?
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答:“双命名法”就是每一种细菌的拉丁文名称由属名和种名两部分构成。属名第一个字母必须大写,其余均应小写,即使种名是以人名或地名命名的,种名头一个字母也用小写,且......

何谓细菌的双命名法?
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Sherlock全自动微生物鉴定系统的工作流程答:①出现在分类学文献中的细菌拉丁文学名,在属名和种名之后,往往还要加上首次定名人(加括号)、现名定名人和现名定名年份等附加信息,如El......

细菌命名中一些常用的规则主要有哪些?
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答:根据“双命名法”,细菌种的拉丁文名称均由属名和种名两部分构成,细菌属或种的名称通常源于细菌“属”或“种”的某一特征,如颜色、形状、地理......

细菌属或种的名称是如何衍生而来的?举例说明
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答:细菌名称的拉丁化的主要规律如下:①细菌的种名与属名的词性必须一致,即拉丁词的词性可分为“阳性”、“阴性”、“中性”三类,如属名的拉丁词......

细菌名称的拉丁化有何规律?举例说明
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答:对于可疑的新属新种,需要从以下两个方面进行论证:提供材料证明实验菌株可以划分入目标菌属/菌科;提供材料证明实验菌株与目标菌属/菌科的其他分类单元在表型、基因型上均存在......

对于可疑的新属新种,其进行进一步验证的实验思路是什么?
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答:①1987年,Wayne等将DNA-DNA杂交实验作为细菌系统分类的一个关键指标,即DNA-DNA关联度ge;70%,且Tmle;5度的菌群为一个种。②1997年,Stackebrandt等发现,97.0%的16S rRNA基因序......

细菌“种”定义的遗传学依据主要有哪些?
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答:目前,16S rRNA基因序列的同源性和系统发生分析是确定细菌分类地位的最简便和快捷的方法,对于任何可疑的细菌新种,都应该先进行细菌的16S rRNA基因测序,再根据16S rRNA基因序列......

如何利用细菌“种”定义的遗传学依据,进行细菌新种的确定?
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答:新分类单元描述的最低标准是国际原核生物系统学委员会(ICSP)分类小组委员会制定的、以有效发表和建立新分类单元为目的的、在提议新分类单元时必须提供的表型、基因型的数据......

何谓新分类单元描述的最低标准?
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国际原核生物系统学委员会对于新分类单元表型、基因型特征的实验资料或实验方法有何要求?答:根据Stackebrandt等2002年在《国际系统与进化微生物学杂志》中公布的资料,对于新分......

原核生物系统学对于新分类单元表型、基因型特征的实验要求
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答:对于发现的细菌新种,可根据该新种的某一特征,如颜色、形状、分布、部位、用途、来源(或地名)、人名等,按“双命名法”的相关规定进行命名。在命名细菌新种时,为保证拉......

如何对细菌新种进行命名?
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答:根据国际原核生物系统学委员会(ICSP)新种认可文件,提议的细菌新种要得到国际上的承认或认可,需要符合以下条件:①以“提议(propose)”的方式,将细菌新种的研究论文在《......

细菌新种该如何得到国际上的承认或认可?
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答:新命名的细菌应该根据其拉丁名的词源来进行翻译。目前,LPSN网站(http://www.bacterio. cict.fr/)按英文字母的排列顺序,提供了每个菌种的词源信息,可按照词源信息中的英文词义......

如何对新命名的细菌进行准确的翻译?举例说明
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