二、蛋白质二级结构的测定与指认

二级结构识别是蛋白质高级结构识别的基础，目前主要有如下识别策略。来自模式识别技术，其仅依据主链肽键基团的坐标判断主链肽键基团间是否形成氢键，计算氢键能量低于? ? 0.5kcal/mol则有氢键形成，用于搜索α螺旋和β片层结构是否存在。另一种二级结构识别方法，将待测主链的α碳原子的坐标与作为参考的二级结构模型进行叠合，测定α碳原子坐标与参考模型的偏离，只要偏离在允许的范围内，就定义属于对应的二级结构类型。对二级结构的识别和基于序列对二级结构的预测，是预测蛋白质三级结构的重要手段，这一直是结构生物信息学的研 ......