第五节 基于结构预测蛋白质功能

蛋白质间序列相似性高于40%时该蛋白质同其相似序列蛋白可能有某些相同生物化学作用。蛋白质间序列保守性低于40%时，可从高级结构预测功能。蛋白质有多个功能域可对应该蛋白质的某些精细功能。从高级结构预测功能实际上是预测蛋白质的某些局部的基本生物化学作用而不是全部生物化学功能。按蛋白质功能分类的数据库如SPIN-PP和MIPS等，为新蛋白功能预测提供了很多有用信息，详见本章第三节。基于基序的方法（motif-based approaches）通过识别功能相关的蛋白质中保守的三维基序，并建立这些保守的基序和保守的 ......