三、芯片、SAGE和MPSS是转录组学研究主要技术

目前，转录组学研究的侧重点涉及基因转录的区域、转录因子结合位点、染色质修饰点、DNA甲基化位点等。微阵列（microarray）、SAGE，以及MPSS是转录组研究的重要技术。其基本原理是利用光导化学合成、照相平版印刷以及固相表面化学合成等技术，在固相表面合成成千上万个寡核苷酸探针（cDNA、ESTs或基因特异的寡核苷酸），并与放射性同位素或荧光物标记的来自不同细胞、组织或整个器官的DNA或mRNA反转录生成的第一链cDNA进行杂交。从SAGE站点，可以获得一些组织和细胞基因差异表达的数据，如正常结肠组织 ......