HCV属黄病毒属,因此对HCV各种裂解蛋白的推测是以黄病毒的编码区为依据的。仅含有单一的ORF,从第4个ATG起始合成蛋白,编码一个3 010~3 033aa的多聚蛋白前体,然后在宿主信号肽酶及HCV NS3蛋白激酶的作用下,裂解成各种病毒蛋白,其中C蛋白、E蛋白为结构蛋白,NS2~NS5为非结构蛋白,P7蛋白的功能尚不清楚。各型HCV ORF长度有所区别,型、Ⅱ型、Ⅲ型HCV ORF分别长约9 030~9 042nt、9 099nt、9 063nt,多聚蛋白前体长分别为3 010~3 014aa、3 0 ......