二、蛋白质三维结构预测方法及软件

目前，蛋白质的结构预测主要有比较建模（comparative modeling，CM）、穿线（threading）及自由建模（free modeling）等三类。通过Blast搜索蛋白质PDB结构数据库，得到目标蛋白质的多个模板三维结构，然后对已知蛋白质进行同源建模和三维结构的重建，结合其他程序进行结构精修和分析，获得高质量的三维结构，并进行相关结构域和活性位点的分析。折叠识别法是近年来发展起来的一种比较新的三维结构预测方法，旨在应用到同源模建不能达到可靠预测的时候，即同源性小于30%的蛋白质通常采用该方 ......