其初衷是将来自于环境中的大量混杂物种的基因集合在某种程度上作为一个单个基因组进行研究分析。根据其研究手段的特殊性,后来加州大学伯克利分校的Chen和Pachter等人又将宏基因组学定义成“无需分离单一菌株,而是利用现代基因组学技术直接研究自然状态下的微生物的有机群落的科学”。目前宏基因组学是一种主要以高通量测序和生物信息学分析为主要研究手段,以环境样品中的微生物群体(主要是细菌和真菌)基因组为研究对象,以阐明微生物多样性,种群结构,分类关系,功能分类,相互间及与环境间的互作关系为研究目的的新兴微生物研究领 ......