三、多序列比对常用工具和数据库

表1-13和表1-14分别列出了常见的多序列比对的软件和数据库。CLUSTAL W软件是一个目前最为普遍使用的多序列比对程序（http：/ / www . ebi . ac . uk / Tools/msa/clustalw2 /），采用渐进的多序列比对方法，先将多个序列两两比对构建距离矩阵，反映序列之间两两关系。对于全基因组序列比对是否使用参照序列以及选用什么序列作为参照序列，这取决于具体序列的特征（包括序列间距离的远近）、对序列的了解（包括对参照序列的了解）、比对的目的（是否主要揭示直系同源区段）以及 ......

——《生物信息学理论与医学实践》

书名：《生物信息学理论与医学实践》

栏目：生物信息学理论与医学实践 > 第一章序列比对与序列特征分析 CHAPTER 1 SEQUENCE ALIGNMENT AND ANALYSIS OF SEQUENCE CHARACTERISTICS > 第三节多序列比对

作者：李霞

参编：张岩，陈秀杰，陈丽娜，王艳秋，刘磊

页码：48-55

版本：1

出版社：人民卫生出版社

出版时间：2013-01-01

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