HEV基因组为单股正链RNA,全长7.2~7.6kb,编码2400~2533个氨基酸(aa),由5 ′端非结构区(NS)和3 ′端结构区(S)组成,5 ′端和3 ′端各有一非编码区(NC),5 ′端NC区长28bp,3 ′端NC区长68bp。该HVR区的核苷酸序列变异较整个HEV基因组高2%,其相应的氨基酸变异高达14%,是整个HEV氨基酸变异的14倍。第91~123aa中包含数个免疫反应性位点,墨西哥株的抗原表位位于近N端(112~117aa),缅甸株的表位更偏近C端(95~101aa),墨西哥株的OR ......